公式より

再ログインができない現象について
CPUキャラクターとのデュエルでエラーが発生した場合に再ログインができなくなる現象に
つきましては、2007年9月10日18:00～18:30の臨時メンテナンスを行い修正いたしました。

なお、デュエル中に異常があった後にログインできない症状が発生した場合、
120分経過後に再ログインが可能となります。

↑
やはりまだ完全にＣＰＵとの互換が取れて
いないようだな。
しっかりメンテせんかい。